وكالة أنباء الحوزة - وجاء نص بيان سماحته على ما يلي:
بالغ الحزن والأسى بلغنا نبأ وفاة الأخ والصديق الوفيّ سماحة العلامة الجليل الفاضل المجاهد الشيخ محمد جعفر شمس الدين (أعلى الله مقامه).
إننا في حوزة الإمام الجواد عليه السلام نرفع تعازينا لمولانا ومقتدانا الأعظم صاحب العصر والزمان أرواحنا فداه وللمراجع العظام والعلماء الاعلام ولكافة المؤمنين لاسيما عائلته وأفراد أسرته الموقرة، سائلين المولى عز وجل أن يلهمهم الصبر والسلوان،كما نسأل الله عز وجل لسماحته علو الدرجة والرحمة والمغفرة الالهية، وأن يسكنه فسيح جناته ومحل رضوانه، وانا لله وانا اليه راجعون .